Совет обеспечивает единую научно-техническую политику Центра и принимает решения по важнейшим вопросам деятельности ФГБУН ЮУрФНКЦ МБ ФМБА России.
К компетенции Совета относятся:
- подготовка предложений по стратегии развития основных научных направлений деятельности Центра;
- прогнозирование развития науки и техники по направлениям деятельности ФГБУН ЮУрФНКЦ МБ ФМБА России;
- подготовка предложений по поддержанию и развитию научно-исследовательской и опытно-экспериментальной базы Центра;
- обсуждение результатов научных исследований отдельных научных сотрудников Центра, а также научных лабораторий (отделов);
- заслушивание отчётов о научно-исследовательской работе по договорам с отечественными и зарубежными организациями;
- выдвижение учёных ФГБУН ЮУрФНКЦ МБ к присвоению учёных званий, почётных званий, присуждению медалей и премий российского уровня, а также к награждению Почётными грамотами;
- выдвижение научных работ и авторских коллективов на соискание Государственных премий, премий Правительства Российской Федерации, золотых медалей и премий имени выдающихся ученых, присуждаемых Российской академией наук, других премий в области науки и техники;
- утверждение тем и апробация докторских и кандидатских диссертаций.